Kao hemikalija, dezinfekciona sredstva zahtevaju posebnu pažnju na mestu skladištenja. Općenito, sredstva za dezinfekciju treba čuvati na dobro-prozračenom, suhom mjestu, daleko od direktne sunčeve svjetlosti i pristupa djece, kao što je hladno i suho mjesto kao što je ostava, ormar ili kutija. Nadalje, treba ih držati podalje od hrane i pića kako bi se spriječilo slučajno gutanje ili pogrešna upotreba. Ako je sredstvo za dezinfekciju tečno, treba ga čuvati u zatvorenoj posudi kako bi se sprečilo curenje. Prilikom skladištenja treba ga držati odvojeno od drugih hemikalija kako bi se izbjegle nezgode.
